Vi khuẩn gây bệnh là vi khuẩn có thể gây ra bệnh.[1] Bài viết này đề cập đến vi khuẩn gây bệnh ở người. Mặc dù hầu hết các vi khuẩn là vô hại hoặc thường có lợi, một số là gây bệnh, với số lượng loài được ước tính ít hơn một trăm được coi là gây ra bệnh truyền nhiễm ở người.[2] Ngược lại, vài ngàn loài tồn tại trong hệ thống tiêu hóa của con người.Một trong những bệnh do vi khuẩn có gánh nặng bệnh tật cao nhất là bệnh lao, do vi khuẩn Mycobacterium tuberculosis gây ra, giết chết khoảng 2 triệu người mỗi năm, chủ yếu ở châu Phi cận Sahara. Vi khuẩn gây bệnh đóng góp vào các bệnh quan trọng khác trên toàn cầu, như viêm phổi, có thể do vi khuẩn như Streptococcus và Pseudomonas, và các bệnh truyền qua thực phẩm, có thể do vi khuẩn như Shigella, Campylobacter và Salmonella gây ra. Vi khuẩn gây bệnh cũng gây ra các bệnh nhiễm trùng như uốn ván, sốt thương hàn, bạch hầu, giang mai và bệnh phong. Vi khuẩn gây bệnh cũng là nguyên nhân gây ra tỷ lệ tử vong ở trẻ sơ sinh cao ở các nước đang phát triển.[3]Các định đề của Koch là tiêu chuẩn để thiết lập mối quan hệ nhân quả giữa vi khuẩn và bệnh.